Existem dois métodos de esterilização para instrumentos médicos usados em cirurgia, ou seja, esterilização a alta temperatura e esterilização a baixa temperatura.
1. Método de esterilização de alta temperatura é usar alta temperatura para desnaturar proteínas microbianas para atingir o objetivo de matar bactérias. É o mais amplamente utilizado clinicamente, e a esterilização a vapor sob pressão é comumente usada, o que é adequado para instrumentos e artigos que podem suportar alta umidade e calor. Há também a esterilização a vapor flash, que pode ser usada para instrumentos e itens simples.
Em segundo lugar, esterilização a baixa temperatura, geralmente usando esterilização com óxido de etileno. A aplicação mais clínica, a vantagem é que não danifica os itens esterilizados, tem forte poder de penetração e tem um bom efeito de matar microorganismos. A esterilização a vapor com formaldeído a baixa temperatura pode ser usada para dispositivos médicos que não resistem a altas temperaturas.
